Materiallar jel elektroforezidan ajratilganidan keyin DNKni tasavvur qilish va suratga olish uchun ishlatilishi mumkin bo'lgan bir nechta turli parda mavjud. Ko'pgina tanlovlar orasida bu beshta suşlar, eng keng tarqalgan bo'lib foydalaniladigan Ethidium bromid bilan eng tez boshlanadi. Ushbu jarayon bilan ishlashda faqat shtammlar orasidagi farqlarni bilish emas, balki sog'liqqa xos xatarlarni bilish muhimdir.
01 Etidiy Brom
Etiodium bromidi DNKni ko'rish uchun ishlatiladigan eng mashhur bo'yoq hisoblanadi. Ushbu bo'yoq, elektroforez tamponunda jel aralashmasida yoki ishlatilgandan keyin jelni bo'yash uchun ishlatilishi mumkin. Boya molekulyarlari DNK iplari va UV nurlari ostida floresani saqlaydi, bunda gellalarning qaerda ekanligini aniq ko'rsatasiz. O'zining afzalliklariga qaramay, salbiy tomonga qaraganda, etidiyum bromidi potentsial karsinogendir, shuning uchun u juda ehtiyotkorlik bilan ishlaydi. Ushbu jel bilan ishlaydigan salomatlik xavfi tufayli alternativa topilgan. 02 SYB Gold
SYB Oltin bo'yoqlari er-xotin yoki bitta ipli DNKni yoki RNKni bo'yash uchun ishlatilishi mumkin. SYB Gold etidium bromidining bozorga chiqish uchun birinchi alternativlaridan biri bo'lib, etidiy bromidan ko'ra sezilarli hisoblanadi. Boya nuklein kislotalarga ulanganidan keyin 1000 barobar ko'prog'i UV floresansini aks ettiradi. Keyin qalin va yuqori miqdorda agaroz jelga kirib, formaldegid jelida foydalanish mumkin. Bog'lanishsiz molekulyarning floresanligi juda past bo'lgani bois, ajralish kerak emas. Litsenziyali molekulalar Problari shuningdek (SYB Goldning ishga tushirilishi bilan) Ebon Bromidga xavfsiz alternativ bo'lgan SYBR Safe va SYBR Green ni ishlab chiqdi va sotdi.
03 SYBR Yashil
SYBR Green I va II parchalari (yana, Molecular Probes tomonidan sotilgan) turli maqsadlar uchun optimallashtirilgan. Ular DNK bilan bog'langanlari uchun, ular hali ham potentsial mutagen deb hisoblanadilar va shuning uchun ularni g'amxo'rlik bilan davolash kerak. SYBR Yashil I, er-xotin ipli DNK bilan foydalanishga nisbatan sezgir bo'lib, SYBR Green II, bir tomonlama DNK yoki RNK bilan ishlash uchun eng yaxshi hisoblanadi. Ommaviy Etidium Bromid bo'yoqlari kabi, bu juda sezgir qoralangan UV nurlari ostida floresan. 04 SYBR Havfsizlik
SYBR Safe'si Ethidium Bromid va boshqa SYBP parchalari uchun xavfsiz alternativ sifatida yaratilgan. Xavfli chiqindilar hisoblanmaydi va odatda oddiy kanalizatsiya tizimlari (masalan, drenajni tushirish) orqali bartaraf qilinishi mumkin, chunki toksikani tekshirish o'tkir toksisit yo'qligini ko'rsatadi. Sinov, Suriya Hamster Embriyo (SHE) hujayralari, inson lenfositleri, sichqonchani lenfoma hujayralari va AMES sinovlaridan kam yoki hech qanday genotoksisite yo'qligini ko'rsatadi. Lekasi DNKni ko'rishga kamroq zarar etkazadigan va undan keyin klonlash uchun yaxshiroq samaradorlikni ta'minlaydigan moviy nurli transilluminator bilan foydalanish mumkin. 05 Eva Yashil
Eva Green - bu boshqa bo'yoqlardan ko'ra PCRni inhibe qilish uchun topilgan yashil floresan bo'yoq. Bu real vaqtda vaqtli PCR kabi ilovalar uchun juda foydali bo'ladi. DNKni tiklash uchun past eritma nuqtali jellardan foydalansangiz ham yaxshi tanlovdir. Yuqori haroratlarda juda barqaror va o'z-o'zidan juda kam flüoresansga ega, lekin DNK bilan bog'langan paytda yuqori darajada flüoresan hisoblanadi. Eva Greenning sitotoksikligi yoki mutajenigi juda past yoki yo'qligi ko'rsatildi.